Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms