Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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