Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp4P59240 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms