Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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