Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HccsP53702 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HccsP53702 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
HccsP53702 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HccsP53702 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HccsP53702 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HccsP53702 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms