Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RorcP51450 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms