Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VdrP48281 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VdrP48281 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms