Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tnfsf9P41274 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tnfsf9P41274 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tnfsf9P41274 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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