Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms