Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms