Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd12P23812 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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