Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RarbP22605 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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RarbP22605 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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RarbP22605 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RarbP22605 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RarbP22605 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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