Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms