Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ntf3P20181 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms