Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P20040 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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