Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms