Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms