Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms