Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms