Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms