Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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