Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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PtprcP06800 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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PtprcP06800 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprcP06800 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprcP06800 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprcP06800 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprcP06800 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprcP06800 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PtprcP06800 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprcP06800 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms