Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H3f3cP02301 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H3f3cP02301 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H3f3cP02301 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H3f3cP02301 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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H3f3cP02301 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H3f3cP02301 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H3f3cP02301 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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