Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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