Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms