Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casq1O09165 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Casq1O09165 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms