Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms