Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Gm6401L7N2C0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Gm6401L7N2C0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Gm6401L7N2C0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6401L7N2C0 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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