Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms