Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms