Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms