Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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