Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms