Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms