Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms