Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms