Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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