Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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