Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AU022751B1B0V2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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AU022751B1B0V2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms