Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ssxb8B1AY40 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ssxb8B1AY40 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ssxb8B1AY40 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ssxb8B1AY40 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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