Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms