Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28036V9GXJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28036V9GXJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms