Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt6bQ9Z331 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt6bQ9Z331 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6bQ9Z331 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms