Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer1Q9Z2Y3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms