Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms