Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gipc2Q9Z2H7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gipc2Q9Z2H7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms