Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd2Q9Z2E1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms