Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp2Q9Z0Z3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms