Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slfn1Q9Z0I7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn1Q9Z0I7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms