Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrknQ9WVS6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrknQ9WVS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms